Третий по величине и самый южный штат Малайзии Джохор имеет площадь 19 984 квадратных километров. К северу от него лежат штаты Малакка и Паханг, а к западу – Малаккский пролив; к востоку – Южно-Китайское море, а к югу – Сингапур, куда можно добраться по двум автодорогам и железной дороге. Самой высокой вершиной Джохора является Гунунг-Леданг высотой 1 276 м.

В состав штата Джохор входят восемь больших островов и многочисленные малые. Самыми известными являются Пулау-Аур, Пулау-Бесар, Пулау-Дайанг, Пулау-Лима, Пулау-Пеманггил, Пулау-Рава, Пулау-Сибу, Пулау-Тенгах и Пулау-Тингги.

Город  Джохор-Бахру находится на южной оконечности полуострова Малайзия. Он является столицей Джохор-Дарул-Такзим с 1855 года, когда он был основан султаном Абу-Такзимом.